Pen | Calf ID | IN:CE | MAP detection with F57 qPCR following culture of individual fecal samples | ||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Days following group housing | |||||||||||||||||
0 | 3 | 5 | 7 | 10 | 12 | 14 | 17 | 19 | 21 | 24 | 26 | 28 | 31 | 33 | |||
1 | 1 | IN | I | C | I | C | C | C | I | I | C | ||||||
1 | 2 | IN | C | I | I | C | I | C | I | I | I | I | |||||
1 | 15 | CE | C | I | |||||||||||||
1 | 16 | CE | C | ||||||||||||||
2 | 3 | IN | C | I | I | C | I | I | I | I | I | I | C | ||||
2 | 4 | IN | I | C | C | I | I | I | I | I | I | I | C | ||||
2 | 17 | CE | C | C | I | C | I | ||||||||||
2 | 18 | CE | C | C | C | ||||||||||||
3 | 5 | IN | C | C | I | C | I | I | I | I | I | ||||||
3 | 6 | IN | C | I | I | I | I | I | I | I | I | ||||||
3 | 19 | CE | C | I | |||||||||||||
3 | 20 | CE | C | C | C | ||||||||||||
4 | 7 | IN | I | C | I | C | I | I | C | ||||||||
4 | 8 | IN | I | I | C | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | |
4 | 21 | CE | C | C | I | ||||||||||||
4 | 22 | CE | C | C | C | C | |||||||||||
5 | 9 | IN | C | I | C | I | I | C | I | I | |||||||
5 | 10 | IN | C | C | I | I | I | I | I | I | I | I | I | ||||
5 | 23 | CE | C | ||||||||||||||
5 | 24 | CE | C | C | C | ||||||||||||
6 | 11 | IN | C | C | C | C | |||||||||||
6 | 12 | IN | I | C | C | C | I | C | |||||||||
6 | 25 | CE | C | C | |||||||||||||
6 | 26 | CE | C | ||||||||||||||
7 | 13 | IN | C | C | C | I | I | C | C | ||||||||
7 | 14 | IN | C | I | C | C | I | I | I | C | |||||||
7 | 27 | CE | C | C | C | C | |||||||||||
7 | 28 | CE | C | C |
Pen | Calf ID | IN:CE | MAP detection with F57 qPCR following culture of individual fecal samples | ||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Days following group housing | |||||||||||||||||
35 | 38 | 40 | 42 | 45 | 47 | 49 | 52 | 54 | 56 | 59 | 61 | 63 | 66 | 68 | |||
1 | 1 | IN | I | I | I | I | I | I | I | I | I | ||||||
1 | 2 | IN | C | I | I | I | C | I | I | I | C | ||||||
1 | 15 | CE | C | I | C | C | |||||||||||
1 | 16 | CE | C | I | I | I | C | ||||||||||
2 | 3 | IN | I | I | I | I | I | I | I | C | |||||||
2 | 4 | IN | I | I | I | I | C | I | C | I | I | I | I | ||||
2 | 17 | CE | I | I | I | C | |||||||||||
2 | 18 | CE | I | C | |||||||||||||
3 | 5 | IN | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I | I |
3 | 6 | IN | I | I | I | I | I | I | I | ||||||||
3 | 19 | CE | C | ||||||||||||||
3 | 20 | CE | C | C | |||||||||||||
4 | 7 | IN | C | I | I | C | C | ||||||||||
4 | 8 | IN | I | I | I | C | |||||||||||
4 | 21 | CE | C | C | |||||||||||||
4 | 22 | CE | |||||||||||||||
5 | 9 | IN | C | I | I | I | I | I | I | I | C | ||||||
5 | 10 | IN | I | I | I | I | C | I | I | I | I | C | I | I | I | ||
5 | 23 | CE | C | ||||||||||||||
5 | 24 | CE | C | ||||||||||||||
6 | 11 | IN | C | C | C | ||||||||||||
6 | 12 | IN | I | C | C | I | I | I | C | ||||||||
6 | 25 | CE | C | ||||||||||||||
6 | 26 | CE | |||||||||||||||
7 | 13 | IN | I | I | I | I | C | I | I | I | |||||||
7 | 14 | IN | I | I | C | C | C | ||||||||||
7 | 27 | CE | C | C | |||||||||||||
7 | 28 | CE | C |
Pen | Calf ID | IN:CE | MAP detection with F57 qPCR following culture of individual fecal samples | INF-ƴ | Tissue culture | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Days following group housing | |||||||||||||||||
70 | 73 | 75 | 77 | 80 | 82 | 84 | 87 | 89 | 91 | 94 | 96 | 101 | |||||
1 | 1 | IN | + | + | |||||||||||||
1 | 2 | IN | + | + | |||||||||||||
1 | 15 | CE | − | + | |||||||||||||
1 | 16 | CE | C | − | − | ||||||||||||
2 | 3 | IN | + | + | |||||||||||||
2 | 4 | IN | + | + | |||||||||||||
2 | 17 | CE | C | + | + | ||||||||||||
2 | 18 | CE | C | + | + | ||||||||||||
3 | 5 | IN | I | I | C | + | + | ||||||||||
3 | 6 | IN | C | + | + | ||||||||||||
3 | 19 | CE | − | + | |||||||||||||
3 | 20 | CE | C | + | + | ||||||||||||
4 | 7 | IN | + | + | |||||||||||||
4 | 8 | IN | + | + | |||||||||||||
4 | 21 | CE | − | + | |||||||||||||
4 | 22 | CE | C | + | − | ||||||||||||
5 | 9 | IN | + | + | |||||||||||||
5 | 10 | IN | I | C | I | I | + | + | |||||||||
5 | 23 | CE | + | − | |||||||||||||
5 | 24 | CE | − | − | |||||||||||||
6 | 11 | IN | + | + | |||||||||||||
6 | 12 | IN | C | + | + | ||||||||||||
6 | 25 | CE | C | − | − | ||||||||||||
6 | 26 | CE | C | C | − | + | |||||||||||
7 | 13 | IN | C | + | + | ||||||||||||
7 | 14 | IN | + | + | |||||||||||||
7 | 27 | CE | − | − | |||||||||||||
7 | 28 | CE | C | − | − |