Skip to main content

Table 2 Species identification of Trichinella larvae

From: Trend analysis of Trichinella in a red fox population from a low endemic area using a validated artificial digestion and sequential sieving technique

#

Animal

Multiplex PCR before freezing

Single larva 5S PCR before freezing

Single larva 5S PCR after freezing

1

67038

T. britovi

T. britovi

T. britovi

T. britovi

T. britovi

NP

NP

NP

2

70414

T. britovi

T. britovi

T. britovi

T. britovi

T. britovi

NP

NP

NS

3

72119

T. britovi

T. britovi

T. britovi

T. britovi

T. britovi

NP

NP

NP

4

72407

T. britovi

T. britovi

T. britovi

T. britovi

T. britovi

NP

NP

NP

5

74391

T. britovi

T. britovi

T. britovi

NP

NP

NP

NS

NP

6

75633

T. britovi

T. britovi

T. britovi

T. britovi

T. britovi

NP

NP

NP

7

75068

T. britovi

T. britovi

T. britovi

T. britovi

T. britovi

NP

T. britovi

T. britovi

8

74497

T. britovi

T. britovi

T. britovi

T. britovi

T. britovi

NP

NP

NP

9

75475

T. britovi

T. britovi

T. britovi

T. britovi

T. britovi

T. britovi

NS

NS

10

75748

T. nativa

T. nativa

T. nativa

T. nativa

ND

NP

NP

NP

11

75630

T. britovi

T. britovi

T. britovi

T. britovi

ND

NP

T. britovi

NP

12

75638

T. britovi

T. britovi

T. britovi

T. britovi

ND

NP

NP

NP

13

75932

T. britovi

NP

T. britovi

T. britovi

ND

NP

NP

NP

14

75933

T. britovi

NP

T. britovi

T. britovi

ND

NP

NP

NP

15

75996

T. britovi

T. britovi

T. britovi

T. britovi

ND

T. britovi

T. britovi

NS

16

76148

T. nativa

T. nativa

T. nativa

T. nativa

ND

NP

T. nativa

T. nativa

17

76575

T. britovi

T. britovi

T. britovi

T. britovi

ND

NP

NP

NP

18

76580

T. britovi

T. britovi

T. britovi

T. britovi

ND

NP

NP

NP

19

76643

T. britovi

T. britovi

T. britovi

T. britovi

ND

NP

NP

NP

20

76644

T. britovi

T. britovi

NP

NP

ND

NP

NP

NP

21

76806

T. britovi

T. britovi

T. britovi

T. britovi

ND

NP

NP

NP

22

77876

T. britovi

T. britovi

T. britovi

T. britovi

ND

NP

NP

NP

23

77885

T. britovi

T. britovi

T. britovi

T. britovi

ND

NP

NP

NP

24

77958

T. britovi

T. britovi

T. britovi

T. britovi

ND

NP

NP

NP

25

78187

T. britovi

T. britovi

T. britovi

T. britovi

ND

ND

ND

ND

26

71102

T. britovi

T. britovi

T. britovi

T. britovi

ND

ND

ND

ND

27

71127

T. britovi

T. britovi

T. britovi

T. britovi

ND

ND

ND

ND

28

71128

T. britovi

T. britovi

T. britovi

T. britovi

ND

ND

ND

ND

29

74449

T. britovi

T. britovi

T. britovi

T. britovi

ND

ND

ND

ND

30

74956

T. britovi

T. britovi

T. britovi

T. britovi

ND

ND

ND

ND

31

wild boar

ND

T. britovi

T. britovi

T. britovi

ND

ND

ND

ND

  1. Species identification was performed on pools of 5 larvae (multiplex PCR) and individual Trichinella larvae (single larva PCR). PCR on individual non-frozen larvae resulted in product for 93 out of 99 larvae (93.9%). PCR on 72 individual frozen larvae yielded PCR product for only 12 larvae, of which 8 resulted in sequence product. NP: no PCR product was formed. NS: PCR product yielded no sequence results due to poor quality of DNA. ND: not done.