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Table 1 PCR primers used in the study

From: Functional characterization of goose IRF1 in IFN induction and anti-NDV infection

Target gene

Purpose

Name

Sequence of oligonucleotide (5′–3′)

GoIFN-α

qRT-PCR

qGoIFN-α F

CTCCAGCACCTCTTCGACAC

qGoIFN-α R

GTTGATGCCGAGGTGAAGGT

GoIFN-γ

qRT-PCR

qGoIFN-γ F

ACATCAAAAACCTGTCTGAGCAGC

qGoIFN-γ R

AGGTTTGACAGGTCCACGAGG

GoIFN-κ

qRT-PCR

qGoIFN-κ F

ACAGCAAAGAAAAGTGATTG

qGoIFN-κ R

GTTGGAAGATCTCTTCAATGG

GoIFN-λ

qRT-PCR

qGoIFN-λ F

GAGCTCTCGGTGCCCGACC

qGoIFN-λ R

CTCAGCGGCCACGCAGCCT

GoIL-6

qRT-PCR

qGoIL-6 F

AGCAAAAAGTTGAGTCGCTGTGC

qGoIL-6 R

TAGCGAACAGCCCTCACGGT

GoIL-8

qRT-PCR

qGoIL-8 F

GCTGTCCTGGCTCTTCTCCTGATT

qGoIL-8 R

GGGTCCAAGCACACCTCTCTGTTG

GoPKR

qRT-PCR

qGoPKR F

GCAACAGCAAAGACTGACGA

qGoPKR R

TGTTTGTGACCTCTGCCTTG

GoOASL

qRT-PCR

qGoOASL F

CAGCGTGTGGTGGTTCTC

qGoOASL R

AACCAGACGATGACATACAC

GoMx-1

qRT-PCR

qGoMx-1 F

TTCACAGCAATGGAAAGGGA

qGoMx-1 R

ATTAGTGTCGGGTCTGGGA

GoIRF1

qRT-PCR

qGoIRF1 F

TGAGAAAGACCCTGACCCCA

qGoIRF1 R

GCTGGAGCCTTTGTTGATGC

To obtain sequence

GoIRF1 F

CTCTGCTTCTGTCACAGCCAC

GoIRF1 R

CTGCAGAAGCCAGGGGTTTAC

Construction of GoIRF1

pcDNA3.1-Flag

EcoR I

tagtccagtgtggtggaattcATGCCCGTCTCCAGAATGCG

pcDNA3.1-Flag

Xho I

gtcgtccttgtagtcctcgagCAAGCCACAGGAGATGGTTTG

Construct truncated forms of GoIRF1

GoIRF1 d1-10 aa F

gtgtggtggaattcatgTGGCTGGAAATGCAG

GoIRF1 d1-10 aa R

CATGAATTCCACCACAC

GoIRF1 d1-50 aa F

gtgtggtggaattcatgGATGCCTGCCTTTTC

GoIRF1 d1-50 aa R

CATGAATTCCACCACAC

GoIRF1 d51-114 aa F

ctgggacatggagaaaTTGACAAAGGATCAG

GoIRF1 d51-114 aa R

TTTCTCCATGTCCCAG

GoIRF1 d120-220 aa F

GCTTCATCCTCGGAAG

GoIRF1 d120-220 aa R

cttccgaggatgaagcCTGATCCTTTGTC

GoIRF1 d201-317 aa F

gactggaggacgccgCTCGAGGACTACAAG

GoIRF1 d201-317 aa R

CGGCGTCCTCCAGTC

GoIRF1 d251-317 aa F

caggactggcacacgCTCGAGGACTACAAG

GoIRF1 d251-317 aa R

CGTGTGCCAGTCCTG