From: Functional characterization of goose IRF1 in IFN induction and anti-NDV infection
Target gene | Purpose | Name | Sequence of oligonucleotide (5′–3′) |
---|---|---|---|
GoIFN-α | qRT-PCR | qGoIFN-α F | CTCCAGCACCTCTTCGACAC |
qGoIFN-α R | GTTGATGCCGAGGTGAAGGT | ||
GoIFN-γ | qRT-PCR | qGoIFN-γ F | ACATCAAAAACCTGTCTGAGCAGC |
qGoIFN-γ R | AGGTTTGACAGGTCCACGAGG | ||
GoIFN-κ | qRT-PCR | qGoIFN-κ F | ACAGCAAAGAAAAGTGATTG |
qGoIFN-κ R | GTTGGAAGATCTCTTCAATGG | ||
GoIFN-λ | qRT-PCR | qGoIFN-λ F | GAGCTCTCGGTGCCCGACC |
qGoIFN-λ R | CTCAGCGGCCACGCAGCCT | ||
GoIL-6 | qRT-PCR | qGoIL-6 F | AGCAAAAAGTTGAGTCGCTGTGC |
qGoIL-6 R | TAGCGAACAGCCCTCACGGT | ||
GoIL-8 | qRT-PCR | qGoIL-8 F | GCTGTCCTGGCTCTTCTCCTGATT |
qGoIL-8 R | GGGTCCAAGCACACCTCTCTGTTG | ||
GoPKR | qRT-PCR | qGoPKR F | GCAACAGCAAAGACTGACGA |
qGoPKR R | TGTTTGTGACCTCTGCCTTG | ||
GoOASL | qRT-PCR | qGoOASL F | CAGCGTGTGGTGGTTCTC |
qGoOASL R | AACCAGACGATGACATACAC | ||
GoMx-1 | qRT-PCR | qGoMx-1 F | TTCACAGCAATGGAAAGGGA |
qGoMx-1 R | ATTAGTGTCGGGTCTGGGA | ||
GoIRF1 | qRT-PCR | qGoIRF1 F | TGAGAAAGACCCTGACCCCA |
qGoIRF1 R | GCTGGAGCCTTTGTTGATGC | ||
To obtain sequence | GoIRF1 F | CTCTGCTTCTGTCACAGCCAC | |
GoIRF1 R | CTGCAGAAGCCAGGGGTTTAC | ||
Construction of GoIRF1 | pcDNA3.1-Flag EcoR I | tagtccagtgtggtggaattcATGCCCGTCTCCAGAATGCG | |
pcDNA3.1-Flag Xho I | gtcgtccttgtagtcctcgagCAAGCCACAGGAGATGGTTTG | ||
Construct truncated forms of GoIRF1 | GoIRF1 d1-10 aa F | gtgtggtggaattcatgTGGCTGGAAATGCAG | |
GoIRF1 d1-10 aa R | CATGAATTCCACCACAC | ||
GoIRF1 d1-50 aa F | gtgtggtggaattcatgGATGCCTGCCTTTTC | ||
GoIRF1 d1-50 aa R | CATGAATTCCACCACAC | ||
GoIRF1 d51-114 aa F | ctgggacatggagaaaTTGACAAAGGATCAG | ||
GoIRF1 d51-114 aa R | TTTCTCCATGTCCCAG | ||
GoIRF1 d120-220 aa F | GCTTCATCCTCGGAAG | ||
GoIRF1 d120-220 aa R | cttccgaggatgaagcCTGATCCTTTGTC | ||
GoIRF1 d201-317 aa F | gactggaggacgccgCTCGAGGACTACAAG | ||
GoIRF1 d201-317 aa R | CGGCGTCCTCCAGTC | ||
GoIRF1 d251-317 aa F | caggactggcacacgCTCGAGGACTACAAG | ||
GoIRF1 d251-317 aa R | CGTGTGCCAGTCCTG |