Table 2 Amino acid sequence of OmpP2 loops L7 and L8 of the 15 serovars of H. parasuis reference strains
Serovar (strains) | Loop7 | Loop8 |
|---|---|---|
Clinical isolate strains | ||
Serovar SC096 | GTYKDKAYKATA | NKDSNNKKVTDQA |
Serovar 1 (No. 4) | · · · · · · · · · · · · | · · · · · · N· · · · · · |
Serovar 2 (SW140) | · · · · · · · · · · · · | · · · · · · · · · · · K· |
Serovar 3 (SW114) | · · · · VEDF · V· · | · · · · D· N· · · · K· |
Serovar 4 (SW124) | · · · · VEDF · · · · | · · N· D· N· · · · K· |
Serovar 5 (Nagasaki) | · · · · · · · · · · · · | · · · · · · · · · · · · · |
Serovar 6 (131) | · · · · VED· · · · · | · · · · D· N· · · · K· |
Serovar 7 (174) | · · · · · · · · · · · · | · · · · · · · · · · · · · |
Reference strains | ||
Serovar 8 (C5) | · · · · VEDF ·V · · | · · · · D· N· · · · K· |
Serovar 9 (D74) | · · · · V· D· · · · · | · · · · D· N· · · · K· |
Serovar 10 (H555) | · · · · VEDF ·V · · | · · · · D· N· · · · K· |
Serovar 11 (H465) | · · · · VE ·F · · · · | · · · · D· N· · · · K· |
Serovar 12 (H425) | · · · · · · · · · · · · | · · · · · · · · · · · · · |
Serovar 13 (84-17975) | · · · · · · · · · · · · | · · · · · · · · · · · · · |
Serovar 14 (84-22113) | · · · · · · · · · · · · | · · · · · · · · · · · · · |
Serovar 15 (84-15995) | · · · · · · · · · · · · | · · · · · · · · · · · · · |