Table 2 Primers used for real-time RT-PCR of ORF 1a
Primer name | Gene | Primer sequence | Amplicon Size |
|---|---|---|---|
cDNA_fw | ORF 1a | 5′-GGT GTT AGG CTT ATA GTT CCT CAG-3′ | 254 nt |
cDNA_rv | ORF 1a | 5′-TAA ACA TTA GGG TTG ACA CCA GT-3′ |  |
T7_fw | ORF 1a | 5′-TAA TAC GAC TCA CTA TAG GGG GTG TTA GGC TTA TAG TTC CTC AG-3′ |  |
qPCR_fw | ORF 1a | 5′-GCT ATT GTA GAG GTA GTG TAT GTG AG-3′ | 176 nt |
qPCR_rv | ORF 1a | 5′-AGG GTT GAC ACC AGT AAA GAA T-3′ |  |