Samples | Farm | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | 16 | 17 | 18 | 19 | 20 | Overall | % |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | No. calves | 171 | 48 | 97 | 160 | 121 | 69 | 263 | 125 | 48 | 153 | 73 | 98 | 110 | 313 | 83 | 59 | 157 | 70 | 184 | 40 | 2442 | 100 |
Analysis | DNA isol. | 44 | 24 | 6 | 92 | 83 | 26 | 11 | 58 | 2 | 67 | 34 | 6 | 6 | 185 | 62 | 26 | 81 | 41 | 52 | 12 | 918 | 37.6 |
 | qPCR + | 11 | 8 | 1 | 17 | 32 | 15 | 2 | 15 | 2 | 10 | 9 | 1 | 1 | 30 | 29 | 12 | 24 | 14 | 6 | 4 | 243 | 10 |
 | Culture + | 2 | 5 | 1 | 8 | 7 | 6 | 2 | 4 | 1 | 5 | 2 | 1 | 0 | 11 | 17 | 7 | 11 | 10 (9) | 2 | 0 | 102 (101) | 4.2 (4.1) |
Ribotype | Toksinotype | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
001/072 | 0 | 1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 1 | 1 |
002 | 0 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 1 | 1 | Â | Â | Â | Â | Â | 1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 3 | 2.9 |
003 | 0 | Â | Â | Â | Â | Â | 1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 1 | 1 |
005 | 0 | Â | Â | 1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 1 | 1 |
012 | 0 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 3 | Â | Â | Â | 1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 4 | 3.9 |
014/020 | 0 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 1 | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | 2 |
018 | 0 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 1 | 1 |
023 | IV | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 1 | 1 |
033 | XIa | 1 | 5 | Â | 8 | 7 | 5 | Â | Â | Â | 1 | Â | 1 | Â | 9 | 16 | 7 | 11 | 6 | Â | Â | 77 | 75.5 |
071 | Tox- | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | 2 | 2 |
077 | 0 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 3 | Â | Â | 3 | 2.9 |
SLO 029 | 0 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 1 | Â | Â | 1 | 1 |
SLO 036 | 0 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 1 | 1 |
SLO 084 | Tox- | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 | 2 |
SLO 116 | Tox- | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 1 | 1 |
SLO 195 | 0 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 1 | 1 |