TY - CHAP AU - Aragon, V. AU - Segalés, J. AU - Oliveira, S. ED - Zimmerman, J. J. ED - Karriker, L. A. ED - Ramirez, A. ED - Schwartz, K. J. ED - Stevenson, G. W. PY - 2012 DA - 2012// TI - Glässer’s disease BT - Diseases of Swine PB - Wiley-Blackwell CY - Chichester, UK ID - Aragon2012 ER - TY - JOUR AU - Olvera, A. AU - Cerdà-Cuéllar, M. AU - Aragon, V. PY - 2006 DA - 2006// TI - Study of the population structure of Haemophilus parasuis by multilocus sequence typing JO - Microbiology VL - 152 UR - https://doi.org/10.1099/mic.0.29254-0 DO - 10.1099/mic.0.29254-0 ID - Olvera2006 ER - TY - JOUR AU - Cerdà-Cuéllar, M. AU - Aragon, V. PY - 2008 DA - 2008// TI - Serum-resistance in Haemophilus parasuis is associated with systemic disease in swine JO - Vet J VL - 175 UR - https://doi.org/10.1016/j.tvjl.2007.01.016 DO - 10.1016/j.tvjl.2007.01.016 ID - Cerdà-Cuéllar2008 ER - TY - JOUR AU - Olvera, A. AU - Ballester, M. AU - Nofrarias, M. AU - Sibila, M. AU - Aragon, V. PY - 2009 DA - 2009// TI - Differences in phagocytosis susceptibility in Haemophilus parasuis strains JO - Vet Res VL - 40 UR - https://doi.org/10.1051/vetres/2009007 DO - 10.1051/vetres/2009007 ID - Olvera2009 ER - TY - JOUR AU - Aragon, V. AU - Bouchet, B. AU - Gottschalk, M. PY - 2010 DA - 2010// TI - Invasion of endothelial cells by systemic and nasal strains of Haemophilus parasuis JO - Vet J VL - 186 UR - https://doi.org/10.1016/j.tvjl.2009.08.013 DO - 10.1016/j.tvjl.2009.08.013 ID - Aragon2010 ER - TY - JOUR AU - Vanier, G. AU - Szczotka, A. AU - Friedl, P. AU - Lacouture, S. AU - Jacques, M. AU - Gottschalk, M. PY - 2006 DA - 2006// TI - Haemophilus parasuis invades porcine brain microvascular endothelial cells JO - Microbiology VL - 152 UR - https://doi.org/10.1099/mic.0.28312-0 DO - 10.1099/mic.0.28312-0 ID - Vanier2006 ER - TY - JOUR AU - Zhang, B. AU - Tang, C. AU - Liao, M. AU - Yue, H. PY - 2014 DA - 2014// TI - Update on the pathogenesis of Haemophilus parasuis infection and virulence factors JO - Vet Microbiol VL - 168 UR - https://doi.org/10.1016/j.vetmic.2013.07.027 DO - 10.1016/j.vetmic.2013.07.027 ID - Zhang2014 ER - TY - JOUR AU - Costa-Hurtado, M. AU - Aragon, V. PY - 2013 DA - 2013// TI - Advances in the quest for virulence factors of Haemophilus parasuis JO - Vet J VL - 198 UR - https://doi.org/10.1016/j.tvjl.2013.08.027 DO - 10.1016/j.tvjl.2013.08.027 ID - Costa-Hurtado2013 ER - TY - JOUR AU - Bouchet, B. AU - Vanier, G. AU - Jacques, M. AU - Gottschalk, M. PY - 2008 DA - 2008// TI - Interactions of Haemophilus parasuis and its LOS with porcine brain microvascular endothelial cells JO - Vet Res VL - 39 UR - https://doi.org/10.1051/vetres:2008019 DO - 10.1051/vetres:2008019 ID - Bouchet2008 ER - TY - JOUR AU - Bouchet, B. AU - Vanicer, G. AU - Jacques, M. AU - Auger, E. AU - Gottschalk, M. PY - 2009 DA - 2009// TI - Studies on the interactions of Haemophilus parasuis with porcine epithelial tracheal cells: limited role of LOS in apoptosis and pro-inflammatory cytokine release JO - Microb Pathog VL - 46 UR - https://doi.org/10.1016/j.micpath.2008.10.008 DO - 10.1016/j.micpath.2008.10.008 ID - Bouchet2009 ER - TY - JOUR AU - Xu, C. AU - Zhang, L. AU - Zhang, B. AU - Feng, S. AU - Zhou, S. AU - Li, J. AU - Zou, Y. AU - Liao, M. PY - 2013 DA - 2013// TI - Involvement of lipooligosaccharide heptose residues of Haemophilus parasuis SC096 strain in serum resistance, adhesion and invasion JO - Vet J VL - 195 UR - https://doi.org/10.1016/j.tvjl.2012.06.017 DO - 10.1016/j.tvjl.2012.06.017 ID - Xu2013 ER - TY - JOUR AU - Zou, Y. AU - Feng, S. AU - Xu, C. AU - Zhang, B. AU - Zhou, S. AU - Zhang, L. AU - He, X. AU - Li, J. AU - Yang, Z. AU - Liao, M. PY - 2013 DA - 2013// TI - The role of galU and galE of Haemophilus parasuis SC096 in serum resistance and biofilm formation JO - Vet Microbiol VL - 162 UR - https://doi.org/10.1016/j.vetmic.2012.08.006 DO - 10.1016/j.vetmic.2012.08.006 ID - Zou2013 ER - TY - JOUR AU - Martínez-Moliner, V. AU - Soler-Llorens, P. AU - Moleres, J. AU - Garmendia, J. AU - Aragon, V. PY - 2012 DA - 2012// TI - Distribution of genes involved in sialic acid utilization in strains of Haemophilus parasuis JO - Microbiology VL - 158 UR - https://doi.org/10.1099/mic.0.056994-0 DO - 10.1099/mic.0.056994-0 ID - Martínez-Moliner2012 ER - TY - JOUR AU - Pina, S. AU - Olvera, A. AU - Barcelo, A. AU - Bensaid, A. PY - 2009 DA - 2009// TI - Trimeric autotransporters of Haemophilus parasuis: generation of an extensive passenger domain repertoire specific for pathogenic strains JO - J Bacteriol VL - 191 UR - https://doi.org/10.1128/JB.00703-08 DO - 10.1128/JB.00703-08 ID - Pina2009 ER - TY - JOUR AU - Costa-Hurtado, M. AU - Ballester, M. AU - Galofré-Milà, N. AU - Darji, A. AU - Aragon, V. PY - 2012 DA - 2012// TI - VtaA8 and VtaA9 from Haemophilus parasuis delay phagocytosis by alveolar macrophages JO - Vet Res VL - 43 UR - https://doi.org/10.1186/1297-9716-43-57 DO - 10.1186/1297-9716-43-57 ID - Costa-Hurtado2012 ER - TY - JOUR AU - Costerton, J. W. AU - Stewart, P. S. AU - Greenberg, E. P. PY - 1999 DA - 1999// TI - Bacterial biofilms: a common cause of persistent infections JO - Science VL - 284 UR - https://doi.org/10.1126/science.284.5418.1318 DO - 10.1126/science.284.5418.1318 ID - Costerton1999 ER - TY - JOUR AU - Hall-Stoodley, L. AU - Costerton, J. W. AU - Stoodley, P. PY - 2004 DA - 2004// TI - Bacterial biofilms: from the natural environment to infectious diseases JO - Nat Rev Microbiol VL - 2 UR - https://doi.org/10.1038/nrmicro821 DO - 10.1038/nrmicro821 ID - Hall-Stoodley2004 ER - TY - JOUR AU - Jacques, M. AU - Aragon, V. AU - Tremblay, Y. D. N. PY - 2010 DA - 2010// TI - Biofilm formation in bacterial pathogens of veterinary importance JO - Anim Health Res Rev VL - 11 UR - https://doi.org/10.1017/S1466252310000149 DO - 10.1017/S1466252310000149 ID - Jacques2010 ER - TY - JOUR AU - Jin, H. AU - Zhou, R. AU - Kang, M. AU - Luo, R. AU - Cai, X. AU - Chen, H. PY - 2006 DA - 2006// TI - Biofilm formation by field isolates and reference strains of Haemophilus parasuis JO - Vet Microbiol VL - 118 UR - https://doi.org/10.1016/j.vetmic.2006.07.009 DO - 10.1016/j.vetmic.2006.07.009 ID - Jin2006 ER - TY - JOUR AU - Jin, H. AU - Wan, Y. AU - Zhou, R. AU - Li, L. AU - Luo, R. AU - Zhang, S. AU - Hu, J. AU - Langford, P. R. AU - Chen, H. PY - 2008 DA - 2008// TI - Identification of gene transcribed by Haemophilus parasuis in necrotic porcine lung through the selective capture of transcribed sequences (SCOTS) JO - Environ Microbiol VL - 10 UR - https://doi.org/10.1111/j.1462-2920.2008.01729.x DO - 10.1111/j.1462-2920.2008.01729.x ID - Jin2008 ER - TY - JOUR AU - Wu, C. AU - Labrie, J. AU - Tremblay, Y. D. N. AU - Haine, D. AU - Mourez, M. AU - Jacques, M. PY - 2013 DA - 2013// TI - Zinc as an agent for the prevention of biofilm formation by pathogenic bacteria JO - J Appl Microbiol VL - 115 UR - https://doi.org/10.1111/jam.12197 DO - 10.1111/jam.12197 ID - Wu2013 ER - TY - JOUR AU - Labrie, J. AU - Pelletier-Jacques, G. AU - Deslandes, V. AU - Ramjeet, M. AU - Auger, E. AU - Nash, J. H. AU - Jacques, M. PY - 2010 DA - 2010// TI - Effects of growth conditions on biofilm formation by Actinobacillus pleuropneumoniae JO - Vet Res VL - 41 UR - https://doi.org/10.1051/vetres/2009051 DO - 10.1051/vetres/2009051 ID - Labrie2010 ER - TY - JOUR AU - Goeres, D. M. AU - Hamilton, M. A. AU - Beck, N. A. AU - Buckingham-Meyer, K. AU - Hilyard, J. D. AU - Loetterle, L. R. AU - Lorenz, L. A. AU - Walker, D. K. AU - Stewart, P. S. PY - 2009 DA - 2009// TI - A method for growing a biofilm under low shear at the air-liquid interface using the drip flow biofilm reactor JO - Nat Protoc VL - 4 UR - https://doi.org/10.1038/nprot.2009.59 DO - 10.1038/nprot.2009.59 ID - Goeres2009 ER - TY - JOUR AU - Tremblay, Y. D. N. AU - Deslandes, V. AU - Jacques, M. PY - 2013 DA - 2013// TI - Actinobacillus pleuropneumoniae genes expression in biofilms cultured under static conditions and in a drip-flow apparatus JO - BMC Genomics VL - 14 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-14-364 DO - 10.1186/1471-2164-14-364 ID - Tremblay2013 ER - TY - JOUR AU - Benoit, M. R. AU - Conant, C. G. AU - Ionescu-Zanetti, C. AU - Schwartz, M. AU - Matin, A. PY - 2010 DA - 2010// TI - New device for high-throughput viability screening of flow biofilms JO - Appl Environ Microbiol VL - 76 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.03065-09 DO - 10.1128/AEM.03065-09 ID - Benoit2010 ER - TY - JOUR AU - Tremblay, Y. D. N. AU - Lamarche, D. AU - Chever, P. AU - Haine, D. AU - Messier, S. AU - Jacques, M. PY - 2013 DA - 2013// TI - Characterization of the ability of coagulase-negative staphylococci isolated from the milk of Canadian farms to form biofilms JO - J Dairy Sci VL - 96 UR - https://doi.org/10.3168/jds.2012-5795 DO - 10.3168/jds.2012-5795 ID - Tremblay2013 ER - TY - JOUR AU - Quail, M. A. AU - Kozarewa, I. AU - Smith, F. AU - Scally, A. AU - Stephens, P. J. AU - Durbin, R. AU - Swerdlow, H. AU - Turner, D. J. PY - 2008 DA - 2008// TI - A large genome centre’s improvements to the Illumina sequencing system JO - Nat Methods VL - 5 UR - https://doi.org/10.1038/nmeth.1270 DO - 10.1038/nmeth.1270 ID - Quail2008 ER - TY - JOUR AU - Quail, M. AU - Swerdlow, H. AU - Turner, D. J. PY - 2009 DA - 2009// TI - Improved protocols for the Illumina genome analyzer sequencing system JO - Curr Protoc Hum Genet VL - 18 ID - Quail2009 ER - TY - JOUR AU - Lunter, G. AU - Goodson, M. PY - 2011 DA - 2011// TI - Stampy : A statistical algorithm for sensitive and fast mapping of Illumina sequence reads JO - Genome Res VL - 21 UR - https://doi.org/10.1101/gr.111120.110 DO - 10.1101/gr.111120.110 ID - Lunter2011 ER - TY - JOUR AU - Xu, Z. AU - Yue, M. AU - Zhou, R. AU - Jin, Q. AU - Fan, Y. AU - Bei, W. AU - Chen, H. PY - 2011 DA - 2011// TI - Genomic characterization of Haemophilus parasuis SH0165, a highly virulent strain of serovar 5 prevalent in China JO - PLoS One VL - 6 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0019631 DO - 10.1371/journal.pone.0019631 ID - Xu2011 ER - TY - JOUR AU - Martin, M. PY - 2011 DA - 2011// TI - Cutadapt removes adapter sequences from high-throughput sequencing reads JO - EMBnet J VL - 17 UR - https://doi.org/10.14806/ej.17.1.200 DO - 10.14806/ej.17.1.200 ID - Martin2011 ER - TY - STD TI - Joshi N: UC Davis Bioinformatics Core. ., [https://github.com/ucdavis-bioinformatics/sickle] UR - https://github.com/ucdavis-bioinformatics/sickle ID - ref32 ER - TY - JOUR AU - Zerbino, D. R. AU - Birney, E. PY - 2008 DA - 2008// TI - Velvet: algorithms for de novo short read assembly using de Bruijn graphs JO - Genome Res VL - 18 UR - https://doi.org/10.1101/gr.074492.107 DO - 10.1101/gr.074492.107 ID - Zerbino2008 ER - TY - STD TI - Gladman S: Velvet Optimiser. ., [http://www.vicbioinformatics.com/velvetoptimiser.manual.txt] UR - http://www.vicbioinformatics.com/velvetoptimiser.manual.txt ID - ref34 ER - TY - STD TI - Seemann T: Prokka User Manual. ., [http://bioinformatics.net.au/prokka-manual.html] UR - http://bioinformatics.net.au/prokka-manual.html ID - ref35 ER - TY - JOUR AU - Oliveira, S. AU - Galina, L. AU - Pijoan, C. PY - 2001 DA - 2001// TI - Development of a PCR test to diagnose Haemophilus parasuis infections JO - J Vet Diagn Invest VL - 13 UR - https://doi.org/10.1177/104063870101300607 DO - 10.1177/104063870101300607 ID - Oliveira2001 ER - TY - STD TI - FastQC: , [http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/] UR - http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/ ID - ref37 ER - TY - STD TI - FASTX-Toolkit:, [http://hannonlab.cshl.edu/fastx_toolkit/] UR - http://hannonlab.cshl.edu/fastx_toolkit/ ID - ref38 ER - TY - STD TI - Torrent Mapping Alignment Program:, [https://github.com/iontorrent/TMAP] UR - https://github.com/iontorrent/TMAP ID - ref39 ER - TY - JOUR AU - Li, H. AU - Handsaker, B. AU - Wysoker, A. AU - Fennell, T. AU - Ruan, J. AU - Homer, N. AU - Marth, G. AU - Abecasis, G. PY - 2009 DA - 2009// TI - The sequence alignment/map (SAM) format and SAMtools JO - Bioinformatics VL - 25 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btp352 DO - 10.1093/bioinformatics/btp352 ID - Li2009 ER - TY - JOUR AU - Thorvaldsdóttir, H. AU - Robinson, J. T. AU - Mesirov, J. P. PY - 2013 DA - 2013// TI - Integrative Genomics Viewer (IGV): high-performance genomics data visualization and exploration JO - Brief Bioinform VL - 14 UR - https://doi.org/10.1093/bib/bbs017 DO - 10.1093/bib/bbs017 ID - Thorvaldsdóttir2013 ER - TY - STD TI - HTSeq v0.5.4p3:, [https://pypi.python.org/pypi/HTSeq] UR - https://pypi.python.org/pypi/HTSeq ID - ref42 ER - TY - JOUR AU - Robinson, M. D. AU - McCarthy, D. J. AU - Smyth, G. K. PY - 2010 DA - 2010// TI - edgeR: a Bioconductor package for differential expression analysis of digital gene expression data JO - Bioinformatics VL - 26 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btp616 DO - 10.1093/bioinformatics/btp616 ID - Robinson2010 ER - TY - JOUR AU - Conesa, A. AU - Götz, S. AU - Garcia-Gomez, J. M. AU - Terol, J. AU - Talon, M. AU - Robles, M. PY - 2005 DA - 2005// TI - Blast2GO: a universal tool for annotation, visualization and analysis in functional genomics research JO - Bioinformatics VL - 21 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bti610 DO - 10.1093/bioinformatics/bti610 ID - Conesa2005 ER - TY - JOUR AU - Käll, L. AU - Krogh, A. AU - Sonnhammer, E. L. PY - 2004 DA - 2004// TI - A combined transmembrane topology and signal peptide prediction method JO - J Mol Biol VL - 338 UR - https://doi.org/10.1016/j.jmb.2004.03.016 DO - 10.1016/j.jmb.2004.03.016 ID - Käll2004 ER - TY - JOUR AU - Bonifait, L. AU - Grignon, L. AU - Grenier, D. PY - 2008 DA - 2008// TI - Fibrinogen induces biofilm formation by Streptococcus suis and enhances its antibiotic resistance JO - Appl Environ Microbiol VL - 74 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.00558-08 DO - 10.1128/AEM.00558-08 ID - Bonifait2008 ER - TY - JOUR AU - Mullins, M. A. AU - Register, K. B. AU - Bayles, D. O. AU - Dyer, D. W. AU - Kuehn, J. S. AU - Phillips, G. J. PY - 2011 DA - 2011// TI - Genome sequence of Haemophilus parasuis strain 29755 JO - Stand Genomic Sci VL - 5 UR - https://doi.org/10.4056/sigs.2245029 DO - 10.4056/sigs.2245029 ID - Mullins2011 ER - TY - JOUR AU - Olvera, A. AU - Pina, S. AU - Macedo, N. AU - Oliveira, S. AU - Aragon, V. AU - Bensaid, A. PY - 2012 DA - 2012// TI - Identification of potentially virulent strains of Haemophilus parasuis using a multiplex PCR for virulence-associated autotransporters (vtaA) JO - Vet J VL - 191 UR - https://doi.org/10.1016/j.tvjl.2010.12.014 DO - 10.1016/j.tvjl.2010.12.014 ID - Olvera2012 ER - TY - JOUR AU - Kaplan, J. B. AU - Velliyagounder, K. AU - Ragunath, C. AU - Rohde, H. AU - Mack, D. AU - Knobloch, J. K. AU - Ramasubbu, N. PY - 2004 DA - 2004// TI - Genes involved in the synthesis and degradation of matrix polysaccharide in Actinobacillus actinomycetemcomitans and Actinobacillus pleuropneumoniae biofilms JO - J Bacteriol VL - 186 UR - https://doi.org/10.1128/JB.186.24.8213-8220.2004 DO - 10.1128/JB.186.24.8213-8220.2004 ID - Kaplan2004 ER - TY - JOUR AU - Tang, J. N. AU - Kang, M. S. AU - Chen, H. C. AU - Shi, X. M. AU - Zhou, R. AU - Chen, J. AU - Du, Y. W. PY - 2011 DA - 2011// TI - The staphylococcal nuclease prevents biofilm formation in Staphylococcus aureus and other biofilm-forming bacteria JO - Sci China Life Sci VL - 54 UR - https://doi.org/10.1007/s11427-011-4195-5 DO - 10.1007/s11427-011-4195-5 ID - Tang2011 ER - TY - JOUR AU - Nance, W. C. AU - Dowd, S. E. AU - Samarian, D. AU - Chludzinski, J. AU - Delli, J. AU - Battista, J. AU - Rickard, A. H. PY - 2013 DA - 2013// TI - A high-throughput microfluidic dental plaque biofilm system to visualize and quantify the effect of antimicrobials JO - J Antimicrob Chemother VL - 68 UR - https://doi.org/10.1093/jac/dkt211 DO - 10.1093/jac/dkt211 ID - Nance2013 ER - TY - JOUR AU - Moormeier, D. E. AU - Endres, J. L. AU - Mann, E. E. AU - Sadykov, M. R. AU - Horswill, A. R. AU - Rice, K. C. AU - Fey, P. D. AU - Bayles, K. W. PY - 2013 DA - 2013// TI - Use of microfluidic technology to analyze gene expression during Staphylococcus aureus biofilm formation reveals distinct physiological niches JO - Appl Environ Microbiol VL - 79 UR - https://doi.org/10.1128/AEM.00395-13 DO - 10.1128/AEM.00395-13 ID - Moormeier2013 ER - TY - JOUR AU - Yadav, M. K. AU - Kwon, S. K. AU - Cho, C. G. AU - Park, S. -. W. AU - Chae, S. -. W. AU - Song, J. -. J. PY - 2012 DA - 2012// TI - Gene expression profile of early in vitro biofilms of Streptococcus pneumoniae JO - Microbiol Immunol VL - 56 UR - https://doi.org/10.1111/j.1348-0421.2012.00483.x DO - 10.1111/j.1348-0421.2012.00483.x ID - Yadav2012 ER - TY - JOUR AU - Dötsch, A. AU - Eckweiler, D. AU - Schniederjans, M. AU - Zimmerman, A. AU - Jensen, V. AU - Scharfe, M. AU - Geffers, R. AU - Häussler, S. PY - 2012 DA - 2012// TI - The Pseudomonas aeruginosa transcriptome in planktonic cultures and static biofilms using RNA sequencing JO - PLoS One VL - 7 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0031092 DO - 10.1371/journal.pone.0031092 ID - Dötsch2012 ER - TY - JOUR AU - Ritter, A. AU - Com, E. AU - Bazire, A. AU - Goncalves Mdos, S. AU - Delage, L. AU - Le Pennec, G. AU - Pineau, C. AU - Dreanno, C. AU - Compère, C. AU - Durour, A. PY - 2012 DA - 2012// TI - Proteomic studies highlight outer-membrane proteins related to biofilm development in the marine bacterium Pseudoalteromonas sp. D41 JO - Proteomics VL - 12 UR - https://doi.org/10.1002/pmic.201100644 DO - 10.1002/pmic.201100644 ID - Ritter2012 ER - TY - JOUR AU - Irie, Y. AU - Mattoo, S. AU - Yuk, M. H. PY - 2004 DA - 2004// TI - The Bvg virulence control system regulates biofilm formation in Bordetella bronchiseptica JO - J Bacteriol VL - 186 UR - https://doi.org/10.1128/JB.186.17.5692-5698.2004 DO - 10.1128/JB.186.17.5692-5698.2004 ID - Irie2004 ER - TY - JOUR AU - Aragon, V. AU - Cerdà-Cuéllar, M. AU - Fraile, L. AU - Monbarg, M. AU - Nofrarias, M. AU - Olvera, A. AU - Sibila, M. AU - Solanes, D. AU - Segalés, J. PY - 2010 DA - 2010// TI - Correlation between clinico-pathological outcome and typing of Haemophilus parasuis field strains JO - Vet Microbiol VL - 142 UR - https://doi.org/10.1016/j.vetmic.2009.10.025 DO - 10.1016/j.vetmic.2009.10.025 ID - Aragon2010 ER - TY - JOUR AU - Blanchette-Cain, K. AU - Hinojosa, C. A. AU - Suresh Babu, R. A. AU - Lizcano, A. AU - Gonzalez-Juarbe, N. AU - Munoz-Almagro, C. AU - Sanchez, C. J. AU - Bergman, M. A. AU - Orihuela, C. J. PY - 2013 DA - 2013// TI - Streptococcus pneumoniae biofilm formation is strain dependent, multifactorial, and associated with reduced invasiveness and immunoreactivity during colonization JO - MBio VL - 4 UR - https://doi.org/10.1128/mBio.00745-13 DO - 10.1128/mBio.00745-13 ID - Blanchette-Cain2013 ER -