From: Different evolutionary trends of swine H1N2 influenza viruses in Italy compared to European viruses
Gene | Number of sequences | Length of alignment (aa) | Mean dN/dS | Positively selected sites | Domain1 | Antigenic site2 | |
---|---|---|---|---|---|---|---|
 |  |  | (95% CI) | P = 0.1 |  |  | |
 |  |  |  | SLAC | FEL |  |  |
H1 avian-like | 61 | 539 | 0.208 (019–0.22) | 116 | 116 | HA1 - E |  |
 |  |  |  | 137 | 137 | HA1 -RBD |  |
 |  |  |  |  | 152 | HA1 -RBD |  |
 |  |  |  | 159 | 159 | HA1 -RBD | Ca |
 |  |  |  | 172 | 172 | HA1 -RBD | Sa |
 |  |  |  |  | 185 | HA1 -RBD | Ca |
 |  |  |  |  | 213 | HA1 -RBD | Sb |
 |  |  |  |  | 232 | HA1 -RBD |  |
 |  |  |  | 239 | 239 | HA1 -RBD |  |
 |  |  |  |  | 392 | HA2 - F |  |
 |  |  |  |  | 399 | HA2 - F |  |
H1 human-like | 65 | 555 | 0.225 (0.21-0.24) | 102 | 102 | HA1 - E | Â |
 |  |  |  |  | 146 | HA1 -RBD |  |
 |  |  |  |  | 158 | HA1 -RBD | Ca |
 |  |  |  |  | 213 | HA1 -RBD | Sb |
 |  |  |  | 271 | 271 | HA1 -RBD |  |
 |  |  |  | 550 | 550 | HA2 - F |  |
N2 EU sw H1N2 | 84 | 469 | 0.185 (0.17-0.20) | Â | 358 | PIR H' | Â |
 |  |  |  |  | 381 |  |  |
 |  |  |  |  | 455 |  |  |
N2 recent Italian H1N2 | 42 | 461 | 0.181 (0.15-0.22) | 0 | 0 | Â | Â |
N2 human H3N2 | 240 | 459 | 0.265 (0.24-0.29) | Â | 43 | PIR A' | Â |
 |  |  |  | 151 | 151 | NA head domain |  |
 |  |  |  | 221 | 221 | Antibody binding |  |
 |  |  |  | 267 |  |  |  |
 |  |  |  |  | 339 | PIR F' | Antigenic site |
 |  |  |  | 370 | 370 |  | Antigenic site |